Dr. Doris Schneider

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Doris Schneider modelliert metabolische Netzwerke und zugehörige regulatorische Mechanismen biomathematisch. Dabei liegt ihr Fokus vor allem auf der ROS-Dynamik und auf metabolischen Strukturen, die bei oxidativem Stress in den Zellen eine wichtige Rolle spielen. Ein bedeutender Teil ihrer Arbeit ist die Parametrisierung der entwickelten mathematischen Modelle. Dazu werden Daten aus verschiedenen in vitro Experimente verwendet.
Sie ist ein Mitglied der AG Neuss-Radu

Forschungsinteressen:

    • biomathematische Modellierung von metabolischen Netzwerken und regulatorischen Mechanismen
    • Dynamik von ROS / oxidativer Stress in Zellen
    • Parametrisierung mathematischer Modelle unter Verwendung verschiedener Daten aus in vitro Experimenten
    • Modellvergleich und Parameterschätzung im Bayesschen Sinne
    • (Markov Chain) Monte Carlo Methoden

Ausbildung

seit 2017 Doktorandin an der FAU Erlangen-Nürnberg unter Betreuung von PD Dr. Maria Neuss-Radu
2014–2017 Masterstudiengang Integrated Life Sciences, FAU Erlangen-Nürnberg
Schwerpunkte:
Mathematical Modelling and Systems Biology
Biological Structures and Processes
Thema der Masterarbeit:
Mathematical Modelling and Simulation of Response Pathways for Cellular Stress
2015 Auslandssemester an der Itä-Suomen yliopisto (University of Eastern Finland) in Joensuu, Finnland (ERASMUS+)
2011–2014 Bachelorstudiengang Integrated Life Sciences, FAU Erlangen-Nürnberg
2011 Abitur am Ostendorfer-Gymnasium Neumarkt i.d.OPf.

Stipendien

07/2019 — 03/2020 Promotionsstipendium im Rahmen des Stipendienprogramms zur “Realisierung der Chancengleichheit für Frauen in Forschung und Lehre“ (FFL)
07/2018 Reisekostenstipendium der FAU (Tagungsförderung für Frauen) zur Teilnahme an der ECMTB 2018
08/2017 Stipendium von „The Alan Turing Institute“, London, zur Teilnahme an der Sommerschule „Mathematical Aspects of Inverse Problems“

Lehrveranstaltungen

      • Assistenz zu den Vorlesungen „Mathematik für Data Science 2“ und „Mathematik für Physikstudierende B“ (SoSe 21)
      • Assistenz zur Vorlesung „Mathematik für Ingenieure E2“ (SoSe 20)
      • Vorlesung „Mathematical Modeling in the Life Sciences“ in Zusammenarbeit mit Frau PD Dr. Maria Neuss-Radu (WiSe 20/21)
      • Assistenz zu den Vorlesungen „Mathematik für Data Science 1“ und „Mathematik für Physikstudierende A“ (WiSe 20/21)
      • Assistenz zur Vorlesung „Mathematik für Ingenieure E2“ (SoSe 20)
      • Assistenz zur Vorlesung „Partial Differential Equations for Life Sciences“ (SoSe 18)
      • Assistenz zur Vorlesung „Biomathematics“ (WiSe 17/18)

Forschungsinteressen

Im Rahmen ihrer Promotion arbeitet Doris Schneider an einem Projekt über die mathematische Modellierung von Stoffwechselwegen, die bei einer zellulären Stressantwort wichtig sind. Um ein mathematisches Modell zu formulieren und anschließend zu parametrisieren, müssen zunächst die relevanten Stoffwechselwege identifiziert und die entsprechenden regulatorischen Mechanismen beschrieben werden.
Zusätzlich entwickelt sie Methoden zur Schätzung von Parametern aus Daten, die aus unterschiedlichen in vitro Experimenten stammen. Insbesondere arbeitet sie ein standardisiertes Vorgehen unter Einbezug von Bayesschen Ansätzen aus, um Daten aus Fluoreszenzassays vor allem im Hinblick auf Cross Talk zu analysieren.

Vorträge

      • „A Bayesian framework for parameter estimation from fluorescence data“, 20. August 2020, eSMB2020, online
      • „Mathematical modelling of cellular response pathways for oxidative stress“, 27. Juli 2018, ESMTB 2018, Lissabon, Portugal

Konferenzen

      • SMB 2020 Annual Meeting (eSMB2020), 17. — 20. August 2020, online
      • 11th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology (ECMTB 2018), 23. — 27. Juli 2018, Lissabon, Portugal
      • Sommerschule: Mathematical Aspects of Inverse Problems, 29. August — 01. September 2017, The Alan Turing Institute, London, UK

Projekte

  • Modellierung der konzentrationsabhängigen Änderungen im Energiestoffwechsel von Urothelzellen nach Exposition gegen 3-Nitrobenzanthron

    (Drittmittelfinanzierte Einzelförderung)

    Laufzeit: 01-01-2017 - 30-06-2019
    Mittelgeber: DFG-Einzelförderung / Sachbeihilfe (EIN-SBH)

2022

2019

Weitere Links: